Capitão Harlock

2977 d.C. A humanidade desenvolveu a tecnologia para ir ao espaço. Eles criaram robôs para cultivar alimentos em outros planetas e vivem numa era de gula sem precedentes. A humanidade recebe todos os seus alimentos do governo e é controlada pelo uso que o governo faz de sinais hipnóticos emitidos pela televisão. Até mesmo altos funcionários do governo abandonaram os seus deveres e vivem uma vida de corridas de cavalos e outras indulgências. O Capitão Harlock, um pirata espacial conhecido em toda a Terra, é o único homem que vê a crise iminente se aproximando. Os únicos homens que ouvem as palavras de Harlock são os membros de sua tripulação na nave espacial Arcádia.

Uma unidade de nave de transporte é atacada por um objeto voador não identificado ao sair do Planeta No.7. Acreditando que Harlock está por trás do ataque, eles decidem usar Mayu, uma garota confiada a Harlock por seu querido amigo, para atraí-lo. Harlock e sua tripulação vivenciam o primeiro ataque agressivo de um misterioso inimigo conhecido como Mazone. Percebendo que estão sob ataque, o Dr. Daiba e seu filho, Tadashi, vão à residência do Primeiro Ministro para implorar ao Primeiro Ministro.

A cidade entra em pânico por uma esfera que pousou. Um homem que inspeciona o orbe junto com o Dr. Daiba e seu filho Tadashi, chamado Professor Kusko, suspeita que a escrita na "Flâmula" está reivindicando a Terra. No entanto, o Primeiro-Ministro continua a ignorar os seus avisos. Então, o líder do invasor Mazone ordena a um subordinado que mate qualquer um que perceba o significado da flâmula.

Depois de ser convidado para ser pirata por Harlock, Tadashi sai do Arcádia. Ao mesmo tempo, o professor Kusko decifra os caracteres escritos na flâmula e informa ao gabinete do primeiro-ministro que os Mazone planejam fazer da Terra sua segunda pátria. No entanto, os governantes não demonstram o menor interesse pelas notícias.

Harlock diz a Tadashi, ao se juntar à sua tripulação, para "apenas passear e se divertir", deixando Tadashi confuso. Além disso, ver todos os tripulantes apenas fazendo o que lhes cabe e relaxando vai completamente contra a imagem que ele tinha do Arcádia. Ficar preso em um espaço tão confinado causa alguns efeitos mentais em Tadashi. Nesse estado, ele tem visões de sua mãe, que morreu no satélite de Netuno, Tritão.

O soldado Mazone mencionou o nome da Rainha Lafresia. Sentindo a necessidade de reunir mais informações e querendo testar as habilidades de Tadashi, Harlock envia a tripulação para reunir pedaços dos destroços do navio de guerra Mazone atacado. A partir da análise dos destroços, eles veem que o Mazone pode ter tido interações com a Terra antiga. Fazendo uma pausa, Harlock envia uma carta para Mayu, que está sob cuidados do governo federal.

Ao ver uma formação estranha vinda do espaço, a tripulação de Harlock segue para a área das Bermudas. Ao investigar uma pirâmide construída pelos Mazone no fundo do oceano, eles descobrem que os Mazone são na verdade uma forma de vida vegetal. Ao saber que os Mazone estão escondidos por todo o mundo e que o governo não deu ouvidos aos seus avisos, a tripulação parte numa missão de busca e destruição. Ao saber que também existem Mazone perto de Mayu, eles decidem matá-los.

Há sinais sendo emitidos pela flâmula e pela pirâmide. Estes são sinais de direção para guiar o Mazone até a Terra. Sentindo o confronto direto e sentindo seu dever de proteger Mayu, filha de seu melhor amigo, Harlock volta para a Terra. Quando eles partem para o espaço sideral, um oficial de alto escalão é capturado e dá um aviso. Quando Harlock a deixa ir, Tadashi sai atrás dela em um ataque de raiva vingativa. Mas quando seu navio é atingido, ele começa a...